Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms