Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf5P70191 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf5P70191 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf5P70191 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf5P70191 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms