Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms