Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms