Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms