Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms