Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace1P56818 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace1P56818 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace1P56818 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace1P56818 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms