Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms