Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CartptP56388 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CartptP56388 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CartptP56388 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CartptP56388 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CartptP56388 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CartptP56388 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CartptP56388 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CartptP56388 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CartptP56388 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CartptP56388 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CartptP56388 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CartptP56388 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CartptP56388 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CartptP56388 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms