Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Sh3bp1P55194 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Sh3bp1P55194 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Sh3bp1P55194 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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