Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms