Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Hoxc13P50207 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Hoxc13P50207 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Hoxc13P50207 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Hoxc13P50207 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Hoxc13P50207 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Hoxc13P50207 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hoxc13P50207 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hoxc13P50207 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hoxc13P50207 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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