Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms