Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VdrP48281 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
VdrP48281 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VdrP48281 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VdrP48281 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VdrP48281 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VdrP48281 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VdrP48281 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VdrP48281 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VdrP48281 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VdrP48281 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VdrP48281 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VdrP48281 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
VdrP48281 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VdrP48281 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VdrP48281 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VdrP48281 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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VdrP48281 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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VdrP48281 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
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VdrP48281 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VdrP48281 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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VdrP48281 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VdrP48281 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VdrP48281 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VdrP48281 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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VdrP48281 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VdrP48281 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VdrP48281 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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VdrP48281 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VdrP48281 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VdrP48281 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VdrP48281 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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VdrP48281 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VdrP48281 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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VdrP48281 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VdrP48281 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VdrP48281 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VdrP48281 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VdrP48281 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VdrP48281 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VdrP48281 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VdrP48281 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VdrP48281 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VdrP48281 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VdrP48281 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VdrP48281 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VdrP48281 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VdrP48281 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VdrP48281 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VdrP48281 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
VdrP48281 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
VdrP48281 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
VdrP48281 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
VdrP48281 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
VdrP48281 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VdrP48281 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VdrP48281 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms