Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 236.3 ms