Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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