Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TfamP40630 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TfamP40630 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TfamP40630 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TfamP40630 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TfamP40630 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TfamP40630 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TfamP40630 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TfamP40630 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TfamP40630 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TfamP40630 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TfamP40630 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TfamP40630 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TfamP40630 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TfamP40630 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TfamP40630 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TfamP40630 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TfamP40630 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TfamP40630 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TfamP40630 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TfamP40630 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TfamP40630 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TfamP40630 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TfamP40630 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TfamP40630 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TfamP40630 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TfamP40630 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TfamP40630 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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