Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtlP38585 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtlP38585 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms