Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc1P34928 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms