Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Hoxc11P31313 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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