Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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