Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms