Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprmP28828 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprmP28828 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprmP28828 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprmP28828 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprmP28828 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprmP28828 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprmP28828 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprmP28828 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprmP28828 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprmP28828 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprmP28828 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprmP28828 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprmP28828 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprmP28828 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprmP28828 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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