Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms