Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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