Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb1P28230 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb1P28230 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb1P28230 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb1P28230 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb1P28230 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb1P28230 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb1P28230 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb1P28230 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb1P28230 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gjb1P28230 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb1P28230 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb1P28230 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gjb1P28230 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gjb1P28230 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb1P28230 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gjb1P28230 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gjb1P28230 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb1P28230 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb1P28230 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb1P28230 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb1P28230 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb1P28230 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms