Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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Pde6aP27664 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Pde6aP27664 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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