Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkchP23298 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkchP23298 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkchP23298 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkchP23298 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms