Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms