Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms