Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntf3P20181 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms