Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VimP20152 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
VimP20152 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VimP20152 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VimP20152 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VimP20152 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VimP20152 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VimP20152 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VimP20152 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VimP20152 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VimP20152 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VimP20152 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VimP20152 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VimP20152 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VimP20152 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VimP20152 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VimP20152 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VimP20152 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
VimP20152 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VimP20152 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VimP20152 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VimP20152 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VimP20152 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VimP20152 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VimP20152 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
VimP20152 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VimP20152 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VimP20152 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VimP20152 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VimP20152 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VimP20152 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
VimP20152 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VimP20152 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VimP20152 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
VimP20152 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VimP20152 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
VimP20152 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VimP20152 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VimP20152 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VimP20152 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VimP20152 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VimP20152 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VimP20152 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VimP20152 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VimP20152 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VimP20152 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VimP20152 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VimP20152 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
VimP20152 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VimP20152 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VimP20152 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VimP20152 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VimP20152 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms