Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

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Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NefhP19246 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NefhP19246 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NefhP19246 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NefhP19246 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NefhP19246 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms