Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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