Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhoP15409 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RhoP15409 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RhoP15409 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RhoP15409 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RhoP15409 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RhoP15409 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RhoP15409 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RhoP15409 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RhoP15409 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RhoP15409 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RhoP15409 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RhoP15409 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RhoP15409 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RhoP15409 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RhoP15409 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RhoP15409 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RhoP15409 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RhoP15409 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RhoP15409 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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