Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb1P14733 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb1P14733 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb1P14733 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb1P14733 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb1P14733 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb1P14733 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb1P14733 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb1P14733 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb1P14733 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb1P14733 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb1P14733 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb1P14733 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb1P14733 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb1P14733 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb1P14733 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmnb1P14733 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmnb1P14733 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmnb1P14733 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmnb1P14733 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmnb1P14733 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms