Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.5 ms