Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DmdP11531 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DmdP11531 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DmdP11531 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DmdP11531 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DmdP11531 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DmdP11531 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DmdP11531 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DmdP11531 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
DmdP11531 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
DmdP11531 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DmdP11531 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DmdP11531 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DmdP11531 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DmdP11531 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DmdP11531 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DmdP11531 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DmdP11531 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DmdP11531 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DmdP11531 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DmdP11531 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DmdP11531 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DmdP11531 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DmdP11531 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DmdP11531 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DmdP11531 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DmdP11531 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
DmdP11531 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DmdP11531 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DmdP11531 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DmdP11531 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DmdP11531 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DmdP11531 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DmdP11531 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DmdP11531 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DmdP11531 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DmdP11531 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DmdP11531 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DmdP11531 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DmdP11531 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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DmdP11531 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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DmdP11531 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DmdP11531 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DmdP11531 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DmdP11531 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DmdP11531 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DmdP11531 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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DmdP11531 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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DmdP11531 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DmdP11531 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DmdP11531 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DmdP11531 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DmdP11531 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DmdP11531 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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DmdP11531 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DmdP11531 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DmdP11531 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DmdP11531 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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DmdP11531 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DmdP11531 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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DmdP11531 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DmdP11531 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DmdP11531 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DmdP11531 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DmdP11531 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DmdP11531 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DmdP11531 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DmdP11531 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DmdP11531 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DmdP11531 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DmdP11531 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DmdP11531 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DmdP11531 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DmdP11531 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DmdP11531 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DmdP11531 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DmdP11531 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DmdP11531 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DmdP11531 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DmdP11531 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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