Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaraP11416 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaraP11416 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaraP11416 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaraP11416 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaraP11416 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaraP11416 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaraP11416 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaraP11416 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaraP11416 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaraP11416 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaraP11416 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaraP11416 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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RaraP11416 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaraP11416 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RaraP11416 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaraP11416 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaraP11416 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaraP11416 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaraP11416 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaraP11416 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaraP11416 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaraP11416 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaraP11416 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaraP11416 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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