Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
P10404 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms