Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PolP10400 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PolP10400 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PolP10400 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PolP10400 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PolP10400 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PolP10400 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PolP10400 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PolP10400 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PolP10400 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PolP10400 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PolP10400 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PolP10400 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PolP10400 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PolP10400 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PolP10400 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PolP10400 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PolP10400 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PolP10400 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PolP10400 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PolP10400 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PolP10400 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PolP10400 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PolP10400 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PolP10400 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PolP10400 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms