Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms