Protein–RNA interactions for Protein: P0C7A0

Khdc1b, KH homology domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1bP0C7A0 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms