Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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