Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
TtrP07309 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
TtrP07309 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
TtrP07309 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
TtrP07309 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
TtrP07309 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
TtrP07309 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
TtrP07309 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TtrP07309 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms