Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01853 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01853 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01853 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01853 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01853 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01853 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01853 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P01853 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01853 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P01853 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01853 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01853 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01853 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01853 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01853 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01853 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01853 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01853 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01853 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01853 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01853 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01853 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01853 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01853 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01853 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01853 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01853 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01853 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01853 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01853 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01853 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01853 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01853 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01853 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01853 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01853 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01853 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01853 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01853 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01853 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01853 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01853 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01853 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01853 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01853 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01853 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01853 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01853 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01853 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01853 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01853 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms