Protein–RNA interactions for Protein: P01659

Ig kappa chain V-III region TEPC 124, mousemouse

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01659 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01659 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01659 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
P01659 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
P01659 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01659 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01659 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01659 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01659 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01659 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01659 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01659 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01659 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01659 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01659 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01659 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01659 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01659 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01659 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms