Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ccl20O89093 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ccl20O89093 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Ccl20O89093 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Ccl20O89093 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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