Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syngr1O55100 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syngr1O55100 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syngr1O55100 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syngr1O55100 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syngr1O55100 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syngr1O55100 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syngr1O55100 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syngr1O55100 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Syngr1O55100 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syngr1O55100 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syngr1O55100 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syngr1O55100 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syngr1O55100 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syngr1O55100 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syngr1O55100 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syngr1O55100 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngr1O55100 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms