Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms